Este trabajo forma parte del Proyecto de Investigación, del Departamento de Economía de la Pontificia Universidad Javeriana - Bogotá (PUJ-B), sobre deserción en los programas de pregrado de esta universidad. Inicialmente se desarrolla un modelo micro-fundamentado que busca explicar los determinantes de la deserción universitaria modelando explícitamente la interacción entre los tres agentes principales del sector de la educación superior: universidades, hogares y estudiantes. El modelo teórico muestra que la deserción universitaria ocurre en estudiantes que tienen un nivel bajo de habilidad innata que los lleva óptimamente a no esforzarse, así como en estudiantes que tienen expectativa de no poder graduarse independientemente de su habilidad innata. Los hallazgos del modelo teórico se evalúan a través de la aplicación empírica de un modelo econométrico de probabilidad (probit) sobre la información recolectada a partir de una encuesta elaborada por los autores y aplicada a una muestra representativa de 473 estudiantes de la población de neo-javerianos de la cohorte del 2006. Se encuentra que el perfil de un desertor está asociado con alguna de las siguientes características: dificultades en matemáticas y expresión oral por baja competencia previa al ingreso a la universidad, pérdida de asignaturas en la universidad, factores disciplinarios con impacto negativo en desempeño, falta de motivación, bajo nivel de esfuerzo durante su permanencia en la universidad y finalmente, la existencia de problemas de índole económico y familiar.